|
|
על מגפות בספרות ועל הקורונה, מחקר ספרותי ומדעי 364 2 Nsp איננו יציב מחוץ לתא שבו הוא מתבטא . השערת המחקר היתה שהשיטות הרגילות לקביעת המבנה שלו ייכשלו, כיוון שכולן מתבססות על הוצאת החלבון מתוך התא וניקויו באמצעים ביוכימיים . מגבלה זו נעקפה על ידי שימוש בשיטה תוך - תאית לחקר המבנה : לתוך התא החי הוכנסה תרכובת כימית הקושרת בצורה בלתי הפיכה שני אתרים בחלבון – שיטה שמכונה צילוב כימי, ( Cross linking ) מאחר שהם קרובים פיזית במבנה התלת ממדי . בהמשך בודד חלבון ה - 2 Nsp בעזרת ספקטרומטר מסות, זוהו אזורים בחלבון הקרובים זה לזה ועברו את שלב הצילוב הכימי . בחלבון הנחקר זוהו יותר מ - 40 נקודות קרבה כאלו, מה שהעיד כי לשרשרת החלבונים הארוכה של 2 Nsp יש מבנה מפותל ומורכב במיוחד . בגלל הרצף הארוך והמבנה המורכב של 2 Nsp , 40 ה"רמזים" על המבנה שלו לא הספיקו כדי לפענח ולהבין עד תום את המבנה האטומי ונדרשה לשם כך תוכנה של חברת בת של גוגל לחיזוי מבנה חלבונים - DeepMind , בשם : 2 Alpha Fold שהצליחה לחזות את המבנה המלא שלו רק במספר תתי מבנים באזורים מצומצמים בתוך הרצף של ה - 2 Nsp . אבל זה הספיק לחוקרים להשלים...
To the book |
|
|